Grouper Users - Open Discussion List

["Kukar, Yuvraj" <>]

Thank you Chris,

Yes, it was working before. Attached, please find the logs and Lib files information. 

On Thu, Dec 1, 2016 at 1:20 PM, Hyzer, Chris <> wrote:

Please stop tomcat.  Delete your logs.  Start tomcat.  Try to access the UI.  Send me all the logs.  Also list the files with size and dates in the WEB-INF/lib dir and send that to me too.

 

Did it work before patching?  Want to try to revert any recent patches you applied and try that too?

 

Thanks

Chris

 

From: [mailto:] On Behalf Of Kukar, Yuvraj
Sent: Thursday, December 01, 2016 1:09 PM
To: Redman, Chad Eric <>
Cc:
Subject: Re: [grouper-users] Getting error while starting tomcat service

 

Thank you. I getting NoClassDefFoundError in that -  

 

Dec 01, 2016 12:46:20 PM org.apache.catalina.core.StandardContext filterStart

SEVERE: Exception starting filter Caller page

java.lang.NoClassDefFoundError: edu/internet2/middleware/subject/util/ExpirableCache

        at edu.internet2.middleware.grouper.util.GrouperUtil.resourcePropertiesCache(GrouperUtil.java:2566)

  

        at java.lang.reflect.Method.invoke(Method.java:606)

        at org.apache.catalina.startup.Bootstrap.start(Bootstrap.java:289)

        at org.apache.catalina.startup.Bootstrap.main(Bootstrap.java:414)

Caused by: java.lang.ClassNotFoundException: edu.internet2.middleware.subject.util.ExpirableCache

        at org.apache.catalina.loader.WebappClassLoader.loadClass(WebappClassLoader.java:1680)

        at org.apache.catalina.loader.WebappClassLoader.loadClass(WebappClassLoader.java:1526)

        ... 26 more

 

Dec 01, 2016 12:46:20 PM org.apache.catalina.core.StandardContext filterStart

SEVERE: Exception starting filter Login check

java.lang.NoClassDefFoundError: edu/internet2/middleware/subject/SubjectNotUniqueException

        at java.lang.Class.getDeclaredConstructors0(Native Method)

        at java.lang.Class.privateGetDeclaredConstructors(Class.java:2585)

      

        at org.apache.catalina.startup.Bootstrap.start(Bootstrap.java:289)

        at org.apache.catalina.startup.Bootstrap.main(Bootstrap.java:414)

Caused by: java.lang.ClassNotFoundException: edu.internet2.middleware.subject.SubjectNotUniqueException

        at org.apache.catalina.loader.WebappClassLoader.loadClass(WebappClassLoader.java:1680)

        at org.apache.catalina.loader.WebappClassLoader.loadClass(WebappClassLoader.java:1526)

        ... 22 more

 

 

On Thu, Dec 1, 2016 at 12:14 PM, Redman, Chad Eric <> wrote:

The log line "(...servlet-api-2.5.jar) - jar not loaded" is normal -- note it's at INFO level. The real error is " SEVERE: Error filterStart". Check the associated localhost.log for the same timestamp, which should have stacktraces for the problem.

 

-Chad

 

 

From: [mailto:] On Behalf Of Kukar, Yuvraj
Sent: Thursday, December 01, 2016 11:56 AM
To:
Subject: [grouper-users] Getting error while starting tomcat service

 

Hello,

 

Need your help in fixing the issue we are facing to restart apache tomcat (grouper service) after installing required UI and API Patches. 

 

Catalina.out logs: 

Dec 01, 2016 11:15:56 AM org.apache.catalina.core.StandardEngine start

INFO: Starting Servlet Engine: Apache Tomcat/6.0.37

Dec 01, 2016 11:16:02 AM org.apache.catalina.loader.WebappClassLoader validateJarFile

INFO: validateJarFile(/app/grouper/grouper.ui-2.2.1/dist/grouper/WEB-INF/lib/servlet-api-2.5.jar) - jar not loaded. See Servlet Spec 2.3, section 9.7.2. Offending class: javax/servlet/Servlet.class

Dec 01, 2016 11:16:03 AM org.apache.catalina.core.StandardContext start

SEVERE: Error filterStart

Dec 01, 2016 11:16:03 AM org.apache.catalina.core.StandardContext start

SEVERE: Context [/grouper] startup failed due to previous errors

Dec 01, 2016 11:16:03 AM org.apache.catalina.startup.HostConfig deployDescriptor

INFO: Deploying configuration descriptor manager.xml

 

The servlet-api jar file is in the lib directory.  I did notice the version mismatch error yesterday in grouper error logs as well which I am not getting today while restart tomcat service. 

 

2016-11-30 13:40:04,504: [main] ERROR GrouperCheckConfig.checkGrouperVersion(1173) -  - grouper versions do not match, GrouperVersion.class: 2.2.2, grouper.version.properties: 2.2.2, manifest: null

 

 

 

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Yuvraj Kukar

University Web & Identity Services

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Yuvraj Kukar

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grouper.ui-2.2.1/dist/grouper/WEB-INF/lib

-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper 4.3M Nov 30 13:34 ojdbc6_g.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper 751K Nov 30 13:34 standard.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper 433K Nov 30 13:34 antlr.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper  20K Nov 30 13:34 opencsv.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper  11K Nov 30 13:34 jython-engine-20080611.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper 279K Nov 30 13:34 spring-core-2.5.6.SEC02.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper 740K Nov 30 13:34 rhino-1.7R1.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper 627K Nov 30 13:34 javassist.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper 258K Nov 30 13:34 commons-io.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper  83K Nov 30 13:34 xml-resolver-1.2.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper 4.5K Nov 30 13:34 jul-to-slf4j-1.6.2.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper  39K Nov 30 13:34 taglibs-request.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper 1.8M Nov 30 13:34 bcprov-jdk15-1.46.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper 691K Nov 30 13:34 hsqldb.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper 1.9M Nov 30 13:34 svnkit-1.3.5.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper  95K Nov 30 13:34 
spring-context-support-2.5.6.SEC02.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper 3.1M Nov 30 13:34 xalan-2.7.1.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper 697K Nov 30 13:34 ddlUtils.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper 168K Nov 30 13:34 stringtemplate-3.2.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper 7.9K Nov 30 13:34 beanshell-engine-20080611.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper 466K Nov 30 13:34 spring-context-2.5.6.SEC02.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper 8.3K Nov 30 13:34 
GrouperHookRestrictedWordCheck-0.0.1-SNAPSHOT.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper 383K Nov 30 13:34 velocity-1.5.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper  11K Nov 30 13:34 groovy-engine-20080611.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper 1.4M Nov 30 13:34 smack.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper  19K Nov 30 13:34 jug.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper 272K Nov 30 13:34 serializer-2.10.0.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper 422K Nov 30 13:34 ant-nodeps-1.7.1.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper 441K Nov 30 13:34 xmlsec-1.4.5.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper 727K Nov 30 13:34 sqljet-1.0.4.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper 191K Nov 30 13:34 spring-web-2.5.6.SEC02.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper 679K Nov 30 13:34 shibboleth-common-1.3.4.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper  64K Nov 30 13:34 jakarta-oro.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper 381K Nov 30 13:34 p6spy.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper  26K Nov 30 13:34 slf4j-api.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper 101K Nov 30 13:34 hibernate-jpa-2.0-api.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper 6.7M Nov 30 13:34 hibernate.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper 359K Nov 30 13:34 esapi-2.0.1.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper 129K Nov 30 13:34 commons-logging.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper 246K Nov 30 13:34 
trilead-ssh2-build213-svnkit-1.3-patch.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper 477K Nov 30 13:34 spring-beans-2.5.6.SEC02.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper 253K Nov 30 13:34 not-yet-commons-ssl-0.3.9.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper  26K Nov 30 13:34 psp-ldap-target-2.2.1.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper 462K Nov 30 13:34 vt-ldap.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper 898K Nov 30 13:34 apache-mina.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper 3.0M Nov 30 13:34 xalan.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper 558K Nov 30 13:34 openws-1.4.3.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper 171K Nov 30 13:34 commons-math.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper  23K Nov 30 13:34 psp-grouper-ldap-2.2.1.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper 2.2K Nov 30 13:34 prefixGroupName.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper 7.5K Nov 30 13:34 
membership-cleaner-1.0.0-SNAPSHOT.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper  37K Nov 30 13:34 js-engine-20080611.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper 458K Nov 30 13:34 commons-lang.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper  46K Nov 30 13:34 commons-codec.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper  25K Nov 30 13:34 xpp3_min.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper  23K Nov 30 13:34 psp-grouper-ldap-2.2.2.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper 531K Nov 30 13:34 joda-time-1.6.2.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper  85K Nov 30 13:34 ezmorph.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper 273K Nov 30 13:34 commons-httpclient.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper 383K Nov 30 13:34 log4j.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper 134K Nov 30 13:34 commons-digester.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper  17K Nov 30 13:34 jcl-over-slf4j-1.6.2.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper  41K Nov 30 13:34 commons-cli.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper 1.9M Nov 30 13:34 grouper-ui.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper 190K Nov 30 13:34 xml-apis.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper  20K Nov 30 13:34 jruby-engine-20080611.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper 295K Nov 30 13:34 openspml2-1.0.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper 250K Nov 30 13:34 json-lib.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper 1.1M Nov 30 13:34 c3p0.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper  77K Nov 30 13:34 morphString.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper 185K Nov 30 13:34 jgrapht-jdk1.5-0.7.3.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper 321K Nov 30 13:34 backport-util-concurrent.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper  19K Nov 30 13:34 psp-grouper-target-2.2.1.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper  42K Nov 30 13:34 odmg.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper 8.2K Nov 30 13:34 jsr107cache.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper 311K Nov 30 13:34 csrfguard.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper 1.2M Nov 30 13:34 commons-collections.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper 185K Nov 30 13:34 serializer.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper 380K Nov 30 13:34 commons-jexl.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper 123K Nov 30 13:34 commons-fileupload.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper  20K Nov 30 13:34 taglibs-datetime.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper  19K Nov 30 13:34 psp-grouper-target-2.2.2.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper  20K Nov 30 13:34 psp-grouper-source-2.2.2.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper 170K Nov 30 13:34 psp-2.2.2.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper 276K Nov 30 13:34 bsh.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper 198K Nov 30 13:34 struts-el.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper 7.7K Nov 30 13:34 
name-check-hook-1.0.0-SNAPSHOT.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper 1.2M Nov 30 13:34 xercesImpl.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper  26K Nov 30 13:34 psp-ldap-target-2.2.2.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper 216K Nov 30 13:34 xml-apis-2.10.0.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper  43K Nov 30 13:34 asm.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper  12K Nov 30 13:34 jargs-1.0.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper 1.8M Nov 30 13:34 ehcache.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper 775K Nov 30 13:34 quartz.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper 676K Nov 30 13:34 xstream.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper 3.2M Nov 30 13:34 ant.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper 494K Nov 30 13:34 struts.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper 839K Nov 30 13:34 jna-3.2.3.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper  99K Nov 30 13:34 grouper-shib-2.2.1.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper  37K Nov 30 13:34 asm-util.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper 170K Nov 30 13:34 psp-2.2.1.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper  15K Nov 30 13:34 scripting-api-1.0.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper 4.1M Nov 30 13:34 grouperClient.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper 295K Nov 30 13:34 openspml2-1.0-SNAPSHOT.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper 8.2K Nov 30 13:34 jta.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper  48K Nov 30 13:34 jstl.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper  75K Nov 30 13:34 commons-discovery.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper  54K Nov 30 13:34 activation.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper 8.2K Nov 30 13:34 
membership-change-hook-1.0.0-SNAPSHOT.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper 438K Nov 30 13:34 mail-1.4.1.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper  28K Nov 30 13:34 invoker.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper 3.1K Nov 30 13:34 
GroupHooksImplExample-0.0.1-SNAPSHOT.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper 237K Nov 30 13:34 commons-betwixt.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper 609K Nov 30 13:34 xmltooling-1.3.3.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper  20K Nov 30 13:34 psp-grouper-source-2.2.1.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper 1.4M Nov 30 13:34 opensaml-2.5.2.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper  97K Nov 30 13:34 grouper-shib-2.2.2.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper 442K Nov 30 13:34 janino-2.5.10.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper 1.4M Nov 30 13:34 xercesImpl-2.10.0.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper 553K Nov 30 13:34 sqljdbc4.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper 714K Nov 30 13:34 dom4j.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper 529K Nov 30 13:34 mysql-connector-java-bin.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper 5.7M Nov 30 13:34 grouper.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper  24K Nov 30 13:34 smtp.old
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper 9.6K Nov 30 13:34 slf4j-log4j12.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper 175K Nov 30 13:34 mailapi.jar.old
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper 148K Nov 30 13:34 antlr-runtime-3.1.3.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper 170K Nov 30 13:34 commons-beanutils.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper  83K Nov 30 13:34 commons-validator.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper 527K Nov 30 13:34 postgresql.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper  41K Nov 30 13:34 
psp-grouper-changelog-2.2.1.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper  41K Nov 30 13:34 
psp-grouper-changelog-2.2.2.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper 275K Nov 30 13:34 jamon.jar
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper 4.6K Nov 30 13:34 
GroupHooksImpl3-0.0.1-SNAPSHOT.jar
-rw-r--r--+ 1 grouper grouper 254K Nov 30 14:31 subject.jar.old
-rw-rw-r--+ 1 grouper grouper 103K Nov 30 14:31 servlet-api-2.5.jar

Attachment: catalina.out
Description: Binary data

Attachment: catalina.2016-12-01.log
Description: Binary data

Attachment: localhost.2016-12-01.log
Description: Binary data